QTL IciMapping 4.2版近日发布

QTL IciMapping是遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位集成软件，软件采用最新的编程技术，把不同功能包装在一个工程中，用户可以随时查看已经完成的各项操作，浏览已完成操作产生的各种结果，软件界面更加友好、功能更加强大。软件4.2版于2019年7月发布。

4.2版具有以下十大功能：1、多环境表型数据方差分析的AOV功能；2、基因型芯片检测数据转换的SNP功能（将遗传群体中个体或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT数据转换为软件需要的格式，用户需要提供亲本基因型才能利用此功能）；3、删除冗余标记的BIN功能；4、构建连锁图谱的MAP功能；5、整合连锁图谱的CMP功能；6、奇异分离位点定位的SDL功能；7、双亲衍生群体QTL作图的BIP功能；8、多环境表型鉴定数据QTL分析的MET功能；9、染色体片段置换系QTL作图的CSL功能；10、巢式关联分析群体QTL作图的NAM功能。另外还提供两个附加工具：1、绘制已构建遗传连锁图谱的MapShow工具；2、两点重组率估计的2pointREC工具。

与4.1版的不同之处：

1、AOV功能中，增加了基因型和环境的稳定性分析，优化了非平衡表型数据（或部分表型缺失数据）的分析方法。

2、增加了基因型芯片检测SNP数据的转换功能，称为SNP功能，作为软件的第2个功能。该功能将遗传群体中个体或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT数据转换为软件需要的格式，用户需要提供两个纯合亲本的基因型数据才能利用此功能。

3、MAP功能中，成对重组率矩阵保存在一个临时文件中，以提高大量标记的处理能力，面前能处理的标记数量可以达到数万个；更多标记的群体，建议先使用BIN功能去除冗余。

4、MAP和CMP功能中，对排序算法进行了优化。

5、同时提供32位和64位两种版本。