QTL IciMapping 4.1版近日发布

QTL IciMapping是遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位集成软件，软件采用最新的编程技术，把不同功能包装在一个工程中，用户可以随时查看已经完成的各项操作，浏览已完成操作产生的各种结果，软件界面更加友好、功能更加强大。软件4.1版于2016年1月发布。

4.1版具有以下九大功能：1、多环境表型数据方差分析的AOV功能；2、删除冗余标记的BIN功能；3、构建连锁图谱的MAP功能；4、整合连锁图谱的CMP功能；5、奇异分离位点定位的SDL功能；6、双亲衍生群体QTL作图的BIP功能；7、多环境表型鉴定数据QTL分析的MET功能；8、染色体片段置换系QTL作图的CSL功能；9、巢式关联分析群体QTL作图的NAM功能。另外还提供两个附加工具：1、绘制已构建遗传连锁图谱的MapShow工具；2、两点重组率估计的2pointREC工具。

与4.0版的不同之处

1、把原来的ANOVA工具变为软件的第一个功能，即AOV功能，并增加了性状相关、环境相关、双标图等分析方法；

2、增加了表型缺少数据的表示方法，即用户可以用“NA”、“na”、“*”、“.”表示缺失性状值，原来的-100表示方法仍然有效；

3、BIN功能中，增加了根据奇异分离严重程度来删除标记的选项；

4、MAP功能中，增加了按照指定分群数目的算法，并对参数界面做了调整；

5、简单区间和完备区间两种QTL定位方法的输出结果中，增加了QTL位置上左右下降一个LOD值的置信区间；

6、所有QTL定位方法的输出结果中，根据定位到QTL的信息，对单个QTL的贡献率（即PVE）进行矫正，矫正后的PVE具有可加性；